Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms