Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms