Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif28pD3YXS5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif28pD3YXS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms