Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc13D3YV10 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms