Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtcflA2APF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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