Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap29-1A2A5X4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms