Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav12-2A0N8N6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trav12-2A0N8N6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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