Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms