Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PapolbQ9WVP6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms