Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp1a4Q9WV27 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms