Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn5Q9WU28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms