Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcl11aQ9QYE3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms