Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms