Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms