Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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