Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3l1Q9D9H3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l1Q9D9H3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms