Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmtm5Q9D6G9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms