Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23bQ9D662 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms