Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930449I24RikQ9D5E3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930449I24RikQ9D5E3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms