Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trappc6bQ9D289 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trappc6bQ9D289 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trappc6bQ9D289 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trappc6bQ9D289 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trappc6bQ9D289 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6bQ9D289 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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