Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PmpcbQ9CXT8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms