Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc2Q9CX47 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc2Q9CX47 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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