Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx28Q9CWT6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddx28Q9CWT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms