Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930519G04RikQ9CPT7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms