Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rtn4Q99P72 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtn4Q99P72 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms