Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcbtb2Q99LJ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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