Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd1Q8K4M5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms