Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vwc2Q8C8N3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vwc2Q8C8N3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms