Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U7

Galnt6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6, mousemouse

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt6Q8C7U7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Galnt6Q8C7U7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Galnt6Q8C7U7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms