Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stk40Q7TNL3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stk40Q7TNL3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms