Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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