Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms