Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms