Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arhgap20Q6IFT4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms