Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtmQ62388 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AtmQ62388 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtmQ62388 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms