Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox19Q62249 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms