Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabl6Q5U3K5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabl6Q5U3K5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms