Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms