Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm12253Q5NC48 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12253Q5NC48 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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