Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a8Q5HZH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms