Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6CQ53S08 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6CQ53S08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms