Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc185Q3V118 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms