Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc160Q3UYG1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms