Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hdgfl2Q3UMU9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms