Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms