Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd11Q1RNF8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms