Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRQ13535 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRQ13535 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRQ13535 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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