Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NrepQ07475 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NrepQ07475 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms