Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms