Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tff2Q03404 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tff2Q03404 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms